菜花如何診斷
1) 肉眼觀察
尖端濕疣常可通過其增生性的外觀來確定。用3%-5%的醋酸溶液可以提高檢出微小和扁平病變的能力，因這種酸溶液可以清除粘液，使細胞脫水。這種反應叫醋酸漂白，可以使發育不良和腫瘤形成的區域出現短暫的發白，但這種技術的假陰性和假陽性都很常見。總體上看，醫生檢查無法檢出大多數的子宮頸HPV感染，也不能發現是否有發育不良。
2) 活體檢驗
活檢可以排除原位癌和早期侵襲性疾病。陰道鏡檢查發現明顯異常的區域常常要用活檢夾取儀器取少量標本檢查。雖然可疑的異常區域比正常組織中的HPV檢出率要高，但大多數可疑組織學改變的活檢標本中HPV陰性。常常通過多次活檢檢查以避免採樣誤差。
3) 尿液分析
性伴侶有子宮頸HPV病變的男性應當接受尿液分析，如果發現顯微鏡血尿，往往表示有尿道或膀胱乳頭瘤。尿液分析也適用於HPV感染的女性。
4) HPV DNA的實驗檢測
核酸雜交檢測（Southern印?、斑點印?和原位雜交）、PCR和液體雜交是HPV DNA檢測和分類的主要方法。因?Southern印?是HPV檢測的最敏感和最特異的方法，所以仍然是研究中的黃金標準方法。PCR方法可以把微量的特異性目標DNA序列擴增到數百萬倍。
因為這種方法高度敏感，所以PCR也可能從症狀已經緩解的病人中檢測出HPV DNA，所以在決定是否要對子宮頸上皮內的瘤形成進行治療時，HPV分類可能有用。
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菜花的新舊療法比一比
傳統治療生殖器疣（菜花）的方法主要是清除疣為主，這些以外科切除治療、塗抹抗腫瘤外用藥物等傳統治療方式，往往有治療過程痛苦、復發率高等問題，而必須至醫療院所持續接受治療，也常讓身染菜花性病的患者備感心理壓力與困擾。
而在傳統療法中，沒有什麼方法可以有效避免造成生殖器疣的主要病因－人體乳突病毒HPV－的感染與複製，或者預防惡性疾病的進展。同時由於生殖器疣周圍的皮膚往往也有無症狀的感染，所以如何針對病毒本身，而不是僅僅清除生殖器疣病灶的治療，是一項重要的課題。
現今治療方式如下：
如何治療
生殖器疣的治療方法傳統上主要是清除疣，往往伴有痛苦，費用高，復發率也高。現在沒有什麼方法可以有效清除生殖器HPV感染和複製，或者預防惡性疾病的進展。因?疣周圍區域往往也有亞臨床感染，所以針對病毒本身而不是僅僅清除疣的治療很有前途。
1) 切除治療
電燒手術
電燒手術是以局部麻醉的方式和手術用的電燒刀燒除生殖器疣，術後局部以抗生素藥膏每天塗抹，約兩星期手術患部可痊癒。根據臨床結果，採用電燒手術的復發率非常高，幾乎達80%以上。而電燒手術有時因醫師臨床經驗不夠，而將海綿體燒壞，久久不能癒合，使患者苦不堪言。
手術剪除
利用外科手術剪除也是常見的生殖器疣治療方式，剪除是肛周和直腸內疣的有效治療方法，復發率相對較低（一項研究的資料29%），操作方法也很安全，可以在門診局麻下治療。往往可以避免結痂和肛門狹窄。
冷凍治療
冷凍治療對微小的孤立生殖器疣和肛門疣有效，這種技術包括對疣和附近小範圍區域實行冷凍，待組織被破壞後再以手術刀切除疣。冷凍療法所使用的藥物是液態氮，其副作用包括疼痛和偶發潰瘍。
雷射燒除
對於較深處的菜花，如尿道內菜花或子宮頸的菜花，藉由二氧化碳雷射蒸發燒除生殖器疣是較合適的治療方式。雷射燒除與其他方法相比的主要優點，是能控制組織破壞的範圍和深度。雷射治療與陰道鏡相結合，可用於治療生殖器疣。但醫生的操作技巧是治療成功的關鍵。
雷射燒除手術的傷口癒合較電燒手術快。這種方法治療時病人往往需要全身麻醉，副作用包括疤痕和疼痛。二氧化碳雷射治療的費用也相當高，但是有健保給付。
2) 局部治療
除了以切除治療的方式清除明顯的生殖器疣病徵外，針對範圍較大、或是較小的生殖器疣也有採取以三氯乙酸（TCA）化學燒灼劑，或Podophyllin、Podophyllotoxin或5FU（5-Fluorouracil）等含抗癌成份的藥膏進行治療。
使用這類藥物要非常小心，因有燒灼及腐蝕的功能，若碰到正常的組織，則會有疼痛感，嚴重會整片組織紅腫潰爛，要好幾個星期才會改善。有些病患可能求好心切，自行增加塗抹劑量及次數，結果導致嚴重的後果。因有這些副作用，所以在一般門診使用時，醫師及患者皆要非常小心。
Podophyllin廣泛用於治療外生殖器疣已經有多年歷史，這種藥物的使用也有一些令人擔心的問題。局部反應有時很嚴重，大範圍塗抹則有全身毒性，極少數情況下可能導致死亡。
Podophyllotoxin是Podophyllin的純化物，因為這種藥物可以自己使用。這樣就減少了看醫生的次數。其全身毒性也比Podophyllin少，局部刺激輕微。但是Podophyllin有致畸作用，所以禁用於孕婦，建議妊娠期間也應當避免用Podophyllotoxin。
外用5-FU已普遍用於治療生殖器疣，特別是尿道內病變，用5-FU治療的效果非常好。5-FU還用於治療陰道內生殖器疣，用這種藥物會引起快速增生組織的壞死和脫落，由於其無法忍受的疼痛而限制了它的應用。因5-FU是一種抗代謝藥，通過上皮表面吸收，所以禁用於孕婦。
3) 免疫反應類型治療－－免疫反應調節劑樂得美乳膏AldaraTM(Imiquimod)
這是一種非切除式以及非組織破壞型的治療，採 用的藥物是Imiquimod，Imiquimod屬於免疫反應調節劑的一種。Imiquimod 5%乳膏劑適用於治療男性和女性病人的外生殖器和肛周疣。
此療法的作用機制是誘發細胞激素與介導性免疫系統，可幫助病患產生自體免疫能力來對抗病毒，新一代的『免疫反應調節劑』不會直接對抗HPV病毒，而是誘發先天性免疫系統，促進細胞激素的釋放，使免疫系統認出並對付帶有HPV病毒的異常宿主細胞，因此由細胞增生而成的疣就會自然消退。
此療法與傳統療法最大的差異與優點，就在於此療法為溫和漸進式的治療方法，常見於組織壞死性療法常見的高復發率，再患者採用免疫反應療法時，因可以由誘發人體自身免疫系統抵抗HPV病毒，來達到治療的效果並大幅降低復發率。
尤其是患者可在家依照醫生指示自行塗抹，免除了組織壞死性療法所造成的疼痛、以及無法兼顧病患隱私的困擾。再者乳膏可以局部施藥，對於大範圍的患部而言尤其適合。
其價格較貴，且治療期需4~8週是主要缺點。
4) 干擾素Intron-A注射治療
干擾素（IFN）能刺激免疫系統，在樂得美乳膏Aldara (Imiquimod)問世以前，是抗病毒治療的唯一方法。干擾素是一類具有抗病毒、抗增生和免疫調節作用的糖蛋白，可以治療HPV感染，用藥方式包括病變部位內注射、和全身皮下注射。
IFN全身用藥有較多副作用，包括：疲勞、發熱、肌肉痛、頭痛、以及血液系統和肝功能試驗的異常。向疣根部注射干擾素（IFN）時有局部疼痛。有些病人（約30%）注射後可能有流行性感冒樣症狀，病變部位內用IFN也需要一週3次的門診治療，因此總體的治療費用也較高，健保不給付。干擾素治療清除外生性疣的效果目前還很有限。